Flohsamen spielen aus medizinischer Sicht vor allem bei der Behandlung von chronischen Verstopfungen und beim Reizdarm-Syndrom eine Rolle – ferner vermögen sie in geringem Ausmaß den Cholesterinspiegel zu senken.
Die empfohlene Tageshöchstdosis für Flohsamen beträgt je nach Quelle etwa 10–30 Gramm – über den Tag verteilt eingenommen. Man lässt dafür mehrmals täglich jeweils einen Teelöffel (5 g) Flohsamen in 100 ml Wasser vorquellen und nimmt diese Menge unter Nachtrinken von ein bis zwei Gläsern Wasser ein.
Weiterer Effekt der Flüssigkeitsbindung: Der Stuhlgang wird weicher und der Körper scheidet vermehrt Gallensäuren aus, was sich positiv auf die Blutfettwerte auswirken kann.